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青海省疾病预防控制中心（以下简称省疾控中心）于2000年6月由原青海省卫生防疫站、省职业病防治院、省地方病防治研究所、省妇幼保健院、省健康教育所合并组建，隶属于省卫生计生委，是从事青海省基本公共卫生服务的公益性全额预算管理县处级事业单位。
设传染病预防控制所、免疫规划所、慢性非传染性疾病预防控制所、卫生检验检测中心、健康教育所、职业与公共卫生所和后勤服务中心，设综合办公室、党委办公室、监察审计科、业务管理部、财务价格部、卫生信息中心、突发公共卫生事件应急管理办公室和质量管理科，并设预防医学门诊部。
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